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ThruPLEX DNA-seq以pg級微量DNA作為起始樣本構(gòu)建文庫，特別設(shè)計接頭免去了中間純化步驟，簡化了文庫制備流程，整個實驗只需15分鐘手動操作且為1個反應(yīng)管、2個小時、3步反應(yīng)的簡單過程。尤其適合少量細胞起始的ChIP測序。

Rubicon ThruPLEX DNA-seq Kit

NGS新一代測序微量樣本DNA文庫制備試劑

英文名稱：ThruPLEX DNA-seq 96D Kit

中文名稱：DNA測序文庫制備試劑

貨號：R400407或RB4407（舊貨號）

品牌：Rubicon Genomics

加樣量 50 pg - 50 ng

反應(yīng)時間 2小時

手動操作 15 min

操作步驟 3步

類型 完整試劑盒，包含illumina測序索引（indexes）

適合樣本 所有打斷的雙鏈DNA

ThruPLEX DNA測序文庫制備試劑基于ThruPLEX化學技術(shù)制備DNA文庫，文庫的多重測序能力提高，具有更高多樣性。試劑zui高包含96個illumina兼容索引（indexes）。ThruPLEX DNA測序文庫制備試劑可用于DNA/RNA 測序和ChIP測序，并與主流目標區(qū)域富集平臺兼容。

ThruPLEX DNA-seq應(yīng)用

全基因組測序（WGS）

全外顯子組測序（WES）

靶向測序

染色質(zhì)免疫共沉淀測序（ChIP-seq）

RNA-seq

應(yīng)用特別介紹：ChIP-seq

ChIP-seq引用文獻：2016至今有11篇ThruPLEX用于ChIP-seq 的高影響因子文章發(fā)表。

簡單的工作流程：3個反應(yīng)步驟在一個管內(nèi)進行，只需2h，手動操作15min

模板修復—末端連接—擴增

組份：

分模板準備、文庫合成和文庫擴增三大部分。保存-20℃。

模板準備緩沖液+模板準備酶（紅色）

文庫合成緩沖液+文庫合成酶（黃色）

文庫擴增緩沖液+文庫擴增酶（綠色）

Illumina索引（indexing） 試劑（藍色）

無核酸酶水（無色）

ThruPLEX DNA-seq特點

高靈敏度、高性能：以低至50 pg至50 ngDNA為起始材料，尤其適合ChIP-DNA

快速簡便的工作流程：單管或單孔3步操作，2小時，無需轉(zhuǎn)移操作

可重復的結(jié)果：構(gòu)建文庫具有高多樣性、低重復度和GC偏差

完整的文庫構(gòu)建試劑：優(yōu)化的illumina index引物和接頭試劑、酶、緩沖液及無核酸酶水

兼容主流目標區(qū)域富集平臺：Agilent SureSelect®, Roche Nimblegen® SeqCap® EZ及 IDT xGen® Lockdown® probes

ThruPLEX技術(shù)—莖環(huán)形 接頭

莖環(huán)形接頭的特別設(shè)計，能夠有效抑制二聚體的形成，免去了大多數(shù)Illumina等文庫制備技術(shù)需要的中間純化和樣品轉(zhuǎn)移步驟。整個實驗只需15分鐘手動操作且為1個反應(yīng)管、2個小時、3步反應(yīng)的簡單過程。僅在PCR反應(yīng)后進行1次磁珠純化，純化造成的樣品損失低，可對珍貴樣品進行有效分析。

莖環(huán)形接頭的設(shè)計降低實驗背景，免去了中間純化步驟。

ThruPLEX DNA-seq 制備文庫高多樣性 低重復度 低GC偏差

ThruPLEX DNA-seq Kit 優(yōu)于其他NGS文庫制備試劑。與其他試劑相比，ThruPLEX DNA-seq Kit可以更少的起始DNA，構(gòu)建多樣性更好（左圖），重復更少（右圖）的文庫（25 M read pairs）。NGS文庫分別采用圖示對照gDNA起始量，以相應(yīng)的文庫制備試劑制備，采用MiSeq v3 flow cell測序。

ThruPLEX DNA-seq Kit 減少了GC偏差。以人類基因組相對覆蓋度為GC含量（%）的函數(shù)（50 ng DNA起始）。（左圖）ThruPLEX DNA-seq Kit 在整個范圍內(nèi)都有出色的覆蓋。（右圖）ThruPLEX DNA-seq Kit （金色）與參試的其他試劑一樣好或更好。請注意，在這些圖中的覆蓋度應(yīng)該為1。人類基因組中的GC含量分布以紅色柱形圖表示。

自備試劑：

Agencourt®XP 核酸純化磁珠（Beckman Coulter，目錄號A63880）

引用文獻：

2017年以來，谷歌學術(shù)上搜索Rubicon ThruPLEX DNA-seq 有94篇文獻。

背景介紹

新一代測序（英文名稱Next Generation Sequencing，縮寫NGS）是一個需求快速發(fā)展的動態(tài)領(lǐng)域。無論樣品類型或應(yīng)用如何，每個樣品都需要制備DNA文庫，以便在Illumina NGS平臺上進行測序。

文庫制備過程（下圖）涉及將Illumina測序接頭與片段DNA連接并添加Illumina兼容索引（indexes）以允許多個樣本的流動池混合測序（多重平行測序）。文庫制備是NGS操作流程的關(guān)鍵步驟，并直接影響測序結(jié)果的質(zhì)量。

隨著NGS臨床應(yīng)用的出現(xiàn)以及隨著NGS測序儀器功能的日益強大，研究人員和臨床醫(yī)師正在越來越多地調(diào)查更加困難和具有挑戰(zhàn)性的樣品，這些樣品數(shù)量有限，使用量少，有的還受損。在許多應(yīng)用中，例如來自血漿的游離DNA，樣品DNA材料有限且高度降解。

在DNA樣本比較珍貴時，例如腫瘤組織的分析，使用少量樣本的能力可以盡可能多的保存樣本用于多種用途。臨床樣品還需要仔細追蹤樣品，樣品從不離開試管的方案有利于確保準確的樣品追蹤并避免污染。這種不斷增長的趨勢需要文庫制備試劑盒，它能夠以簡單的工作流程精確地保留樣本的復雜性并提供更高的靈敏度和更高的多重測序能力。

滿足這些需求是ThruPLEX DNA測序試劑的核心。它的開發(fā)旨在提高多重測序能力，并從少量樣本制備高品質(zhì)、兼容Illumina的NGS文庫。ThruPLEX DNA-seq的三步式單管文庫制備是業(yè)界zui簡單的操作流程，可zui大限度地減少處理錯誤和寶貴樣品的損失。

名詞解釋：ChIP-seq 結(jié)合DNA測序分析蛋白與DNA的相互作用，確定DNA相關(guān)蛋白的結(jié)合位點。

ChIP：染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也稱結(jié)合位點分析法。

ChIP測序也稱為ChIP-seq，是一種用于分析蛋白質(zhì)與DNA相互作用的方法。 ChIP-seq將染色質(zhì)免疫沉淀（ChIP）與大規(guī)模平行DNA測序相結(jié)合，以確定DNA相關(guān)蛋白的結(jié)合位點。它可以用來精確地定位任何目標蛋白質(zhì)的結(jié)合位點。

ThruPLEX DNA-seq訂購信息

R400407/RB4407為期貨

Rubicon公司成立于2000年，總部位于美國密歇根州。產(chǎn)品都擁有技術(shù)，檢控嚴格，擁有cGMP級生產(chǎn)能力，是單細胞測序文庫構(gòu)建的。2017年1月，Rubicon 成為Takara的一員，并且發(fā)展良好。

華雅再生醫(yī)學旗艦公司：紅榮微再（上海）生物工程技術(shù)有限公司主營細胞治療和精準醫(yī)療等產(chǎn)品，2018年與TAKARA繼續(xù)合作，授權(quán)代理（上海）其旗下Rubicon單細胞文庫構(gòu)建試劑等產(chǎn)品。

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